Bioinformatique Intégrative

Institut Paoli Calmettes

Responsable de plateforme

Grandjeaud Samuel - CRCM

Responsable de plateforme

La plateforme Cibi offre un large panel d’expertises et de services en bioinformatique (intégration de données, développement d’analyses biologiques sur mesure) et développe des pipelines bioinformatiques de pointe. Nos ingénieurs développent également des bases de données à visée biologique pour le stockage et la gestion de données.

La plateforme Cibi offre les services suivants:

  • Analyse et intégration de données de type NGS (Next Generation Sequencing : ChIP-Seq, RNA-Seq, single cell RNA-Seq, analyse de Variants Génétiques à visée recherche et diagnostique)
  • Analyse de données de cytométrie en flux et cytométrie de masse
  • Analyse de données de Protéomique
  •  

Notre expertise est également articulée dans le développement logiciel :

  • Développement de pipelines bioinformatique et de bases de données (Python, R, Bioconductor, RShiny, Django, PostgreSQL, etc)
  • Collaboration sur projet (INCa, ANR, ARC, etc)

Nos Pipelines

les publications à la une

09/2024

Grenier JMP , Testut C, Bal M, Bardin F, De Grandis M, Gelsi-Boyer V, Vernerey J, Delahaye M, Granjeaud S, Zemmour C, Spinella JF, Chavakis T, Mancini SJC, Boher JM, Hébert J, Sauvageau G, Vey N, Schwaller J, Hospital MA, Fauriat C, Aurrand-Lions M.

08/2022

Toumi E, Goutorbe B, Plauzolles A, Bonnet M, Mezouar S, Militello M, Mege JL, Chiche L, Halfon P .

10/2024

Rondeau V, Kalogeraki M, Roland L, Nader ZA, Gourhand V, Bonaud A, Lemos J, Khamyath M, Moulin C, Schell B, Delord M, Bidaut G, Lecourt S, Freitas C, Anginot A, Mazure N, McDermott DH, Parietti V, Setterblad N, Dulphy N, Bachelerie F, Aurrand-Lions M, Stockholm D, Lobry C, Murphy PM, Espéli M, Mancini SJC, Balabanian K.

04/2022

Rigo R, Chelbi R, Agopian J, Letard S, Griffon A, Ghamlouch H, Vernerey J, Ladopoulos V, Voisset E, De Sepulveda P , Guittard G, Nunès JA, Bidaut G, Göttgens B, Weber M, Bernard OA, Dubreuil P , Soucie E

Labels, Financements et Partenaires

Logo Aix Marseille université CRCM partenaires Logo Inserm partenaire CRCM CNRS logo partenaire CRCM Institut Paoli Calmettes unicancer Marseille CRCM